Dissertação - Caroline Busatto

PREVALÊNCIA DE MICOBACTÉRIAS AMBIENTAIS E GENOTIPAGEM DE Mycobacterium avium ISOLADOS DE PACIENTES ATENDIDOS NO HOSPITAL UNIVERSITÁRIO DR. MIGUEL RIET CORRÊA Jr.

Autor: Caroline Busatto (Currículo Lattes)

Resumo

As micobactérias ambientais e não pertencentes ao complexo Mycobacterium tuberculosis nominadas micobactérias não tuberculosas (MNT) constituem um grupo heterogêneo de bactérias, amplamente distribuídas na natureza e associadas a infecções oportunistas em humanos. Além disso, podem causar doença pulmonar que são na maioria das vezes indistinguíveis da tuberculose (TB), o que representa um desafio para o diagnóstico e a conduta terapêutica, visto que, o tratamento é espécie-específico. O uso de ferramentas moleculares permite, além de uma identificação mais rápida e precisa da MNT envolvida no processo infeccioso, a análise genotípica dos isolados de uma mesma espécie. O primeiro objetivo deste trabalho foi realizar uma revisão bibliográfica sobre a principal micobactéria identificada depois do M. tuberculosis, o M. avium. Sequencialmente, foi determinada a prevalência das MNT em pacientes suspeitos de TB e realizada a genotipagem da MNT mais prevalente. Para isto realizou-se um estudo transversal, de caráter retrospectivo, onde foram incluídas amostras recebidas no Laboratório de Micobactérias do Nucleo de Pesquisa em Microbiologia Médica (NUPEMM), da Faculdade de Medicina da Universidade Federal do Rio Grande (FURG), no período de janeiro de 2014 à dezembro de 2016. As amostras positivas cultivadas no sistema automatizado líquido BACTECTM MGITTM 20 e negativas na identificação molecular do complexo M. tuberculosis através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) de IS-6110 foram submetidas a PCR para a detecção dos genes hsp65 e rpoB. As amostras positivas para estes genes tiveram os amplicons do hsp65 e rpoB sequenciados para identificação da espécie de MNT. Posteriormente, com as amostras identificadas como M. avium, foi realizada a genotipagem através da técnica MIRU-VNTR 8 loci (Mycobacterial Interspersed Repetitive Units-Variable Number of Tandem Repeats). Do total de 1.248 pacientes suspeitos de tuberculose, foram obtidas 332 culturas positivas de micobactérias, das quais 7,5% (25/332) foram identificadas como MNT. As espécies de MNT identificadas foram M. avium (72,0%), M. abscessus (20,0%), M. gastri e M. kansasii (4,0%). A análise das 18 cepas de M. avium através de MIRU-VNTR resultou na formação de um cluster, onde duas cepas foram geneticamente relacionadas. Esses dois pacientes eram HIV positivos e apresentavam relação entre as datas das consultas, os exames e internações hospitalares. Este estudo ressalta a necessidade da investigação de MNT em pacientes suspeitos de TB. Sendo o M. avium a principal espécie de MNT identificada, especialmente em indivíduos com HIV.

TEXTO COMPLETO DA DISSERTAÇÃO